本會創立於民國四年、其時值日據時代，命為「溪口信用販賣利用購買組合」。

至民國３３年２月１日改組為「溪口庄農業會」，台灣省光復後於民國３５年１２月３１日改稱「溪口鄉合作社」，迨至民國３８年１１月２１日再改稱「溪口農會」。

民國４４年農會因理事拒保糧食局委託業務，吊銷業務，改由大林、民雄、新港等三鄉鎮分擔服務後，始由前總幹事張麗瞳力圖振興、慘淡經營，農會日漸健全於民國５５年建造辦公廳舍。